苦瓜中含有较多的草酸，草酸能与食物中的钙结合，影响人体对钙的吸收。若长期大量食用苦瓜，会导致钙质缺乏症。苦瓜含有一种叫“多肽—P”类似胰岛素的物质，具有降糖的功能，因而，患有低血糖的不宜多食。苦瓜性味苦寒，多食易损脾败胃，因此不要空腹食用，脾胃虚寒、慢性胃肠炎患者应少食或不食。此外，处在月经期时，也应暂时和苦瓜保持距离。