首先是典型的症状，表现为第一个是胃灼热和反酸，胃灼热甚至胸骨后和剑突下的烧灼感，都在餐后一小时出现，平卧、弯腰或腹压增高时容易发生，反流入口腔的味道常呈酸性，故称为反酸。反酸常伴胃灼热，是本病最常见的病临床表现。第二个是吞咽疼痛和吞咽困难，还有异物感，严重食管炎或食管溃疡的患者，可出现吞咽的疼痛，是由酸性反流物刺激食管上皮下的感觉神经末梢所引起的，反流物也可刺激机械感受器，引起食管痉挛性的疼痛，严重时可为剧烈的刺痛，可以向腰、背、肩、颈部放射，由于食管痉挛或功能紊乱，部分患者可有吞咽的困难，发生食管狭窄，吞咽困难持续的加重。第二，其他食管外症状，反流物刺激咽部黏膜可引起咽喉炎，出现似咽部的不适或异物感，吸入气道可发生咳嗽、哮喘，这种哮喘没有明显的季节性，常在夜间发生阵发性的哮喘和咳嗽，个别的患者反复发生吸入性的肺炎，严重的患者可以出现肺间质的纤维化。