调节肠道菌群有三大类，包括益生菌，是指通过改善宿主肠道菌群生态平衡而发挥有益作用，达到提高人的健康水平和健康状态的活菌制剂及其代谢产物。有双歧杆菌、乳杆菌等。再就是益生元，通过有益菌的繁殖增多，抑制有害细菌生长，从而达到调整肠道菌群，促进机体健康的目的。有乳果糖、蔗糖低聚糖等，还有一种就是合生素，是指益生菌和益生元同时并存的制剂，临床应用比较少。