丙戊酸钠能够引起的副作用有很多，如可以使服药者出现消化不良以及腹泻的现象，还可能导致肠道以及胃部痉挛，女性服用这种药物容易引发月经改变，甚至可以导致女性月经不调。这种药还能够导致服药者呕吐恶心，丙戊酸钠服药期间有些人可能出现短暂的脱发以及便秘现象，还有的人则会有困倦嗜睡的症状，这种药能够使药物使用者出现乏力以及头晕现象。常见不良反应表现为腹泻、消化不良、恶心呕吐、胃肠道痉挛，可引起月经周期改变，较少见短暂的脱发、便秘、眩晕、疲乏、头痛，共济失调，轻微震颤，异常兴奋，不安和烦躁，长期服用偶见胰腺炎及急性肝坏死，可使血小板减少，引起紫癜，出血和出血时间延长，应定期检查血象，对肝功能有损害，引起血清碱性磷酸酶和氨基转移酶升高，服用2个月要检查肝功能，偶有过敏。