健康人的胃肠内居住的多种的维生素，这些维生素称之为肠道菌群。肠道菌群是按一定比例组成的，它们之间形成了一个生态的平衡。但是一旦体内外的环境发生变化，特别是长期应用广谱抗生素的时候，这些肠道菌群会被抑制，而没有被抑制的细菌趁机繁殖，从而引起菌群失调。其中的正常的生理组合被破坏产生的一些临床症状，就称为肠道菌群失调症。本症状主要以严重的腹泻或慢性腹泻为主。在应用抗生素治疗过程中，如果突然发生腹泻或原有腹泻加重，极有可能发生本病。