风湿病发病的原因有很多种，主要跟遗传、内分泌因素、环境因素表观遗传学对基因的表达，调控免疫异常、感染等相关。风湿病的疾病种类众多，包括风湿热、类风湿性关节、系统性红斑狼疮、干燥综合征、白塞病、皮肌炎等。大部分的风湿病跟遗传因素密切相关。比如系统性红斑狼疮是一种多基因遗传性疾病，其发病常需要多个基因的共同作用。目前认为HLA二类基因较一类基因与系统性红斑狼疮的相关性更为明显。而类风湿性关节炎，根据近年来全基因组扫描发现，它的发病与HLA-DR和HLA-DQ相关。而强直性脊柱炎与HLA-B27相关。白塞病与HLA-B51和HLA-B12以及HLA-B27相关，皮肌炎与HLA-DR相关。当然，其他所提到的病因也是风湿病的病因。