根据患者病因、临床表现相结合的方法。如心血管系统、呼吸系统、神经系统、血液系统、肾脏系统、胃肠系统、肝脏系统等，多个系统的多个指标才可明确诊断是否出现多脏器功能障碍综合征。比如，循环系统如果血压降低设置休克，或者需要药物支持才能维持内环境的稳定呼吸，出现了难以依靠自身能力，来缓解的呼吸困难。或者影像学出现了明显的病变表现。还有肝脏系统出现了巩膜、皮肤黄染，或者生化检查有明显的异常等等。