3岁的宝宝肚子疼发烧的时候，首先考虑的疾病就是肠系膜淋巴结炎，需要赶快带孩子去医院做肠系膜淋巴结的B超检查。如果确诊以后，需要给孩子直接服用抗生素来进行治疗。平时也要顺时针给孩子揉一揉肚子，可以有效缓解孩子肚子疼的症状。另外，肚子疼也不排除是阑尾炎的情况，也需要做腹部的B超才能够排除。如果是阑尾炎，需要根据B超的结果来决定打针治疗还是直接手术治疗。发烧超过38.5℃的时候，需要给孩子进行退烧治疗。