人体在空腹状态下胃肠蠕动和代谢作用十分旺盛，胃酸分泌增加，抽烟时会加重胃酸分泌，抑制胰腺分泌碳酸氢钠，致使十二指肠酸负荷增加，诱发溃疡。烟草中烟碱可使幽门括约肌降低，使胆汁易于返流，从而削弱胃十二指肠黏膜的防御因子，促使慢性炎症及溃疡的发生，并使原有溃疡延迟愈合，吸烟可以降低胃食管下括约肌张力，易造成反流性食管炎。