松果体脑瘤与松果体区域中出现的生殖细胞肿瘤不同，松果体细胞肿瘤直接来自腺体松果体实质细胞的功能细胞，松果体实体细胞是参与处理视觉刺激的专门神经细胞。松果体细胞瘤分为松果细胞瘤，松果体细胞瘤和混合松果体肿瘤。松果体细胞瘤通常生长缓慢且良性，而松质母细胞瘤具有攻击性和恶性。混合松果体肿瘤是松果细胞瘤和松果体细胞瘤的组合。