高密度脂蛋白偏低首先针对病因的治疗。有基础疾病的要治疗基础疾病；有吸烟习惯的要戒烟；有营养不良的要加强营养，合理饮食；肥胖的患者要控制饮食和体重，多运动，运动可升高高密度脂蛋白；血脂高的患者可口服调脂药，调脂药中的烟酸是一个较为全效的药物，有升高高密度脂蛋白，降低低密度脂蛋白和甘油三酯的作用。