孕酮低对女性的身体可造成较大的危害，尤其是妊娠期的女性，严重者可导致不孕、反复流产。孕酮低只有病因治疗才能解除危害。黄体功能不全引起孕酮不足者通过口服或肌注黄体酮来治疗；甲状腺功能亢进导致体内孕酮分泌不足者可口服抗甲亢药物；除了药物治疗外，还需要注意饮食和生活作息，避免熬夜和心情焦虑，多食用富含黄体酮的食物如大豆、草莓等。