巧克力囊肿是有会复发的几率。导致巧克力囊肿复发的因素是多方面的，巧克力囊肿术后只要节饮食，慎起居，注意个人卫生的护理，可以有效地降低巧克力囊肿的复发几率。平时过度的劳累，情绪的抑郁，饮食起居的不当，局部卫生的不洁都会对人体内分泌造成一定的影响，从而导致巧克力囊肿的复发。所以平时要注意定期进行健康体检，以便复发时及时进行治疗。