目前提供的呼气试验普遍使用碳13或者碳14这两种同位素。就诊断效果而言，这两者几乎没有区别，区别在于碳13是天然存在的稳定性同位素，而碳14则具有微弱的放射性；因碳13呼气试验无创伤、无放射性、准确性高，尤其适用于儿童、孕妇、年老体弱等人群。碳13呼气试验和碳14呼气试验都是用来检测幽门螺杆菌感染的。