目前临床上应用的手足口病疫苗是肠道病毒71型灭活疫苗。接种本疫苗之后可以刺激机体产生抵抗EV71的免疫力，预防EV71感染所导致的手足口病。基础的免疫程序是2剂次，时间间隔1个月，每次的剂量是0.5ml。发热是接种手足口病疫苗后十分常见的不良反应、体温大多数在38摄氏度左右、2天左右缓解，个别情况会达到39摄氏度以上。