艾滋病病毒感染者在窗口期很少出现不适，但部分艾滋病感染者病情进展较快，会在窗口期出现发热、盗汗、皮疹、腹泻及淋巴结肿大等急性期症状，持续1~3周，除持续性有淋巴结肿大症状外，其他可自行消退。在窗口期虽测不到艾滋病病毒抗体，但处于窗口期的感染者体内的艾滋病病毒载量会达到峰值，传染性极强。