胆囊切除术最主要的危害是术中有可能损伤胆总管，损伤包括显性的损伤和隐性的损伤，显性的损伤如果处理不当或者没有积极处理，容易造成胆汁性腹膜炎，而隐性的损伤多是由于热传导所导致的，会造成胆管狭窄，造成反复发作的胆管炎和梗阻性黄疸，会对肝脏造成明显的损伤，多需要进行胆肠吻合术，术后可能出现反复发作的胆管炎，胆管结石，甚至诱发胆管癌等。