飞秒激光仪器精密复杂，费用昂贵，手术过程中瞬间眼压很高，可能对眼底有一定的影响。术后可能出现视觉质量下降，高阶像差增加，导致术后夜间视力下降，眩光、光晕。角膜切削比较多可能有发生角膜扩张，圆锥角膜的风险。术后感染，干眼症等。但只要术前详细检查，合理设计，术中规范操作，术后定期回医院复查，有问题及时处理，一般不会产生明显的眼睛危害。