引起扁平疣的病原微生物是人类乳头瘤，是一种DNA病毒，通过直接接触或间接传染引起。酞丁安软膏为抗病毒外用药物，其作用机制是抑制病毒DNA和早期蛋白质合成，从而抑制其生长速度，并达到逐渐消退病毒这种病原微生物结果。因此从酞丁安的功效及引起扁平疣的病原微生物(即人类乳头瘤病毒)属性来说，酞丁安对扁平疣是有着一定的治疗作用，但是眼周扁平疣慎用（可能会有一定刺激性）。