新生儿消化不良的原因主要是由于新生儿的消化系统发育不是太完善，他的一些酶，肠道黏膜的消化液都不是发育得非常成熟，所以容易消化不良，吃东西之后容易吐。还有一个就是消化的食物，容易出现稀便，这些特点往往跟他的消化功能不完善有一定的关系。有一部分孩子是消化道的畸形，比方胃的扭转，还有幽门肥厚，往往也出现小孩或吐奶、漾奶。