怀孕40天的时候吃感冒药对孩子是有影响的，因为在孕早期胎器官形成时，药物对胎儿有一定的影响，故感冒的时候不要吃药，怀孕吃感冒药对孩子有影响，主要是看服用药物的种类，一般的中成药都没有影响，但必须在医生指导下服用，原则上孕妇不服用任何药物。妊娠后，孕妇体内酶有一定的改变，对某些药物的代谢过程有一定的影响。药物不易解毒和排泄，可有蓄积性中毒。