胎儿心律不齐的原因如下，首先，由于窦性心律不齐引起。很多胎儿会有窦性心律不齐，大多属于生理性的现象。其发生的机制是由于在胎儿呼气以及吸气的时候引起胸腔压力不同，从而导致心率波动不齐。其次，由于患有心肌炎导致的症状。如果胎儿感染病毒会侵袭心肌细胞，从而导致心肌损伤。心肌损伤后心肌的电生理发生变化就会引起心律不齐。