由于克罗恩病可以影响到很多脏器，主要是小肠，所以它的症状就跟它所处的部位有关系。以小肠为例，主要是腹痛，腹痛跟病变的严重程度有很大的相关性。病变轻，腹痛不是很剧烈，时间也比较短，有的反复发作；病情比较重的，疼痛比较剧烈，持续时间也比较长。因为肠道炎症的刺激，它可以出现腹泻。腹泻症状的轻重，也是跟炎症的程度有很大的相关性。