眼肌型肌无力的治疗应首先明确病因，然后给予相应的治疗。眼肌无力可以表现为眼睑下垂，重症肌无力可以通过口服溴吡胺和维持疗法来治疗。急性重症肌无力也可以用甲泼尼龙或丙种球蛋白治疗，动眼神经麻痹也会导致眼肌无力和上睑下垂。颅内动脉瘤引起的动眼神经麻痹需要介入栓塞或手术治疗。脑梗死引起的动眼神经麻痹可通过活血化瘀、抗血小板聚集、营养神经等方法进行治疗。