肾小管损伤的治疗需要针对病因进行治疗。如果是腹泻、呕吐、中暑等原因造成的身体脱水，进而影响到肾脏血液供应，需要输液，甚至输血，恢复肾脏的血液供应。如果是药物、食物中毒引起的肾小管损伤，需要尽快清除掉身体内的毒物，有的病人还需要使用糖皮质激素来控制肾小球、肾小管以及肾间质的炎症。如果是风湿性系统的疾病，比如干燥综合征，病人可能需要使用糖皮质激素以及免疫抑制剂进行治疗。