食管镜和胃镜检查的过程基本相似，也是经咽喉部进入食管，观察是否存在食管病变。其主要引起的临床不适症状为恶心，恶心的严重程度还需要根据患者的个人体质以及内镜医师的熟练程度来决定。肥胖、男性、长期吸烟以及咽喉部敏感的人群进行食管镜检查时，有可能出现比较强烈的恶心症状，甚至不能耐受检查，是非常痛苦的。但是由于食管镜一般只需几分钟即可完成，大部分人群经咽部应用麻醉药后是可以耐受的。