卵巢囊肿手术不算大手术，因为各级医院的收费标准是不同的，手术的性质也是不同的，有开腹手术，还有做腹腔镜手术两种。所以费用上也有所差距。三甲医院做手术，采用腹腔镜治疗的话，大概费用应该在1万多。如果仅仅是开腹治疗的话，那么有几千块钱就可以了。