手足口病是肠道病毒感染导致发病，有多样性症状，危重病的发病机制，目前不完全清楚。一般认为病毒通过消化道，或呼吸道侵入机体后，主要是由于咽部和肠道上皮细胞，表面相应的病毒受体结合，结合以后病毒进入到细胞内。肠道病毒主要在扁桃体、咽部和肠道的淋巴结，大量的复制以后，释放到血液当中，引起相应的组织和器官，发生一系列的炎症反应。