睡觉起来如全身酸疼，最常见的病因是感冒的初期，无论风寒感冒还是风热型感冒，在感冒初期的时候，病原微生物侵入体内，此时会产生免疫应答，会自觉周身酸疼，是体内将多余毒素排出体外的过程。或者是运动量过大会启动无氧糖酵解途径，释放体内多余的糖分，这时身体会代谢出过多的乳酸，乳酸会在身体骨骼肌较为丰富的地区进行堆积，尤其以睡醒时乳酸蓄积尤为明显，会导致周身酸疼的临床症状。