引起肛门疼痛的原因比较多，通常是由肛门本身的因素所造成。比如最常见的肛裂，肛裂一般是由肛门狭窄所引起，每次大便时就会引起肛门内括约肌暴露，所以产生肛门疼痛，这是由于括约肌痉挛所造成，而不是由于括约肌本身的损伤所造成。肛裂引起的疼痛，一般呈周期性，多发于大便时或大便后，主要由粪便刺激和溃疡裂口扩张所致。其疼痛为阵发性灼痛或刀割样疼痛，可持续数分钟，待粪便通过后，疼痛减轻。