输卵管检查的时候痛不痛，要根据输卵管通畅情况才可以决定。例如在月经干净后3天进行输卵管检查的时候，输卵管双侧都是通畅的，这时候可能不会觉得很痛，可以忍受，可能会存在有胀胀的感觉，在通水之后就会慢慢消退，不会影响身体健康，可以忍受。如果输卵管进行检查的时候，双侧输卵管都不通畅，这时候可能会存在有比较疼痛，不能忍受的情况发生，说明双侧输卵管堵塞，持续2-3天才会慢慢缓解。