若是反酸或糜烂出血者，可给予抑酸剂和黏膜保护剂。若腹胀、恶心、呕吐者，可给予胃动力药。若是胃痉挛疼痛者可以给予解痉剂。若是贫血明显，给予维生素B12和叶酸药物治疗。幽门螺杆菌是慢性萎缩性胃炎的常见病因之一，若检测幽门螺杆菌感染，则需要加用抗生素药物治疗。若萎缩性胃炎伴高级别瘤变者，可考虑进行内镜下黏膜切除或内镜下黏膜剥脱术治疗。