自身免疫性的损伤引起，常见的有桥本甲状腺炎、产后甲状腺炎、萎缩性甲状腺炎等。甲状腺腺体本身破坏，例如进行甲状腺的手术，或放射性碘131治疗破坏部分甲状腺。过量使用碘，造成具有潜在性的甲状腺损害进一步加重。药物作用，尤其在治疗甲亢的过程中，运用了抗甲状腺药物，在减药的过程中，如果没有进行及时减药，可能会出现暂时性药物性甲减。