病毒性发烧和细菌性发烧其主要不同是感染的病菌类型不同，发病特点也有所区别。病毒性发烧具有明显的群体发病特点，短期内会传染给周围的人群。而细菌性发烧主要是散发性发病，单独发病，一般不具有传染性。病毒性发烧一般流鼻涕症状和咽喉症状比较明显。而细菌性发烧，主要是扁桃体和咽喉红肿疼痛比较明显。