骶管囊肿手术费用大约5-6万块钱，如果骶管囊肿相对比较复杂，有多发的囊肿或囊肿比较大，处理措施相对复杂一点，而且术后住院时间长，费用就会高一点，有可能超过6万块钱。根据各个医院，包括医院的级别，以及做手术的大夫，还有就是医保，包括新农合，这些的报销比例不同，费用可能有差异。