冲击波治疗副作用，一般表现为肾脏的损伤。由于冲击波冲击力较大，在击碎结石的过程中，会造成肾脏实质、髓质的冲击伤，病情严重者甚至会出现肾功能不全、肾脏萎缩的表现。还有就是继发性输尿管结石和输尿管扩张。较大的肾结石，经冲击波击碎后排入输尿管内，如果发生嵌顿，会造成输尿管结石，从而引起强烈的痉挛性疼痛。输尿管结石嵌顿较紧，会造成输尿管积水、输尿管扩张，最后造成肾功能不全。