肾结石的治疗方法要根据肾结石的大小，数量以及有无并发症等来进行选择。小于五毫米的结石，可以通过多饮水，并口服排石药物来进行药物排石。直径在六毫米和两公分之间的结石，可以通过体外冲击波碎石，并结合药物排石进行治疗。大于两公分的结石或者多发结石，需要用微创的手术方法来进行治疗，包括经尿道输尿管软镜下肾结石钬激光碎石取石术，或者经皮肾镜肾结石超声碎石取石术。