肾囊肿可能随年龄的增大而长大，注意定期复查，只要不长大，不出现症状时可以不用处理。肿物较大且有恶变可能时，可以进行手术探查，如果证实为良性囊肿，可将肾表面的囊壁切除，边缘用肠线与肾实质连续缝合，残留囊壁涂以药物，一侧肾实质广泛破坏，对侧肾功能正常者，可行肾切除术。