对于肝脏的多发性囊肿，不主张手术处理，仅限于处理引起明显症状的大囊肿，可以行囊肿穿刺抽液或者腹腔镜下开窗引流，以缓解压迫的症状。病变局限于肝的一段或一叶时，如果出现明显的症状病情允许，可以进行病变的肝段或肝叶切除术，对于病变十分广泛的肝脏多发囊肿，如果肝组织破坏，严重出现了肝功能的衰竭，引起了腹水，黄疸和门静脉高压，肝移植是唯一有效的方法。