胃肠上皮化生的治疗主要是首先在饮食方面注意合理均衡，避免辛辣刺激油腻食物，注意养成良好的生活习惯，少熬夜，戒烟酒，注意保证情绪稳定，还需要配合一些药物治疗，目前最有效的药物是胃复安胶囊和叶酸片，还有塞来昔布，这些都是认为有效果的。还需要定期复查胃镜。如果有服用对胃粘膜有损伤的药物，建议权衡利弊以后尽量停用。