三个月的宝宝有咳嗽的症状，说明是宝宝的呼吸系统受到致病菌的感染导致的气管和肺部发炎，一般常见的致病菌有病毒，细菌或者支原体等，致病菌的不同，使用的治疗药物也会不同，需要带宝宝去做血常规检查，根据血象结果判断是病毒感染还是细菌感染，然后再针对致病菌选择抗病毒的药物或者抗生素来消炎抗感染治疗，还需要配合使用止咳化痰的药物。