苦参凝胶用后烧的疼可能是由于患者体质虚弱，免疫功能低下而引起的过敏性反应，这是临床中常见的一种症状，建议患者及时到医院的就诊，在医生的指导下积极治疗，苦参凝胶具有很好的抗菌，消炎的作用，主要因主要应用于治疗阴道炎，宫颈糜烂，赤白带下，滴虫性阴道炎等疾病。患者还需注意平时的卫生，多清洗，多吃蔬菜水果，增强免疫能力。