复方小檗碱鞣酸蛋白胶囊主要通过吸附作用与消炎作用，治疗肠道感染性疾病。吸附作用成份能有效吸附肠道内病毒、细菌及其他一些有害物质，并对胃黏膜形成一定保护，减少不良刺激对黏膜损害。其他消炎作用成份能直接杀灭进入肠道的致病微生物，或者消除异常增生的肠道细菌病毒等，消除肠道感染。也适用于一般非感染性肠道疾病。