儿童胶质瘤的原因可能是基因突变和神经干细胞在发育过程中发生突变，从而向肿瘤干细胞分化有一定关系。除此之外，还可能与头部治疗剂量的放射线辐射、电离辐射以及其他因素。因为儿童处在生长发育期，中枢神经系统也处在生长发育期，在发育过程中任何的外界因素的干扰，或者是先天因素不全，生长发育期间都有可能导致儿童患胶质瘤。