血常规特点与大多数病毒感染类似。艾滋病窗口期血常规会有白细胞、血小板计数和比例减少，单核细胞增多等特点。其中比较显著的特点是淋巴细胞计数大量减少，主要是由于艾滋病病毒攻击CD4T淋巴细胞导致，淋巴细胞数量出现一过性的快速减少。急性期过后淋巴细胞可逐渐恢复，但通常不能回到原来的水平。