月经干净三天后同房一般不会怀孕，但也是有怀孕可能的。通常在月经干净后属于安全期，但也有可能会出现排卵的现象，所以就有可能会出现怀孕，所以在月经干净后三天如果同房，最好采取有效的避孕措施，比如带避孕套。而且同房前后，都需要对阴部进行温水清洗，减少细菌滋生。