同房时小腹疼痛可能是由于患有妇科疾病引起的，还有可能是在同房的时候动作过于激烈的原因。如果是患有妇科疾病可以遵医嘱口服消炎药进行治疗，还要注意局部的卫生，在性生活的时候动作一定要温柔，而且还要避免性生活过于频繁，可以缓解疼痛的情况。