新生儿心脏上面有小孔可能是先天性心脏病导致的，也有可能是在生长发育过程中发育不完善引起的，在怀孕后要按时到医院进行检查身体，胎儿每个月发育情况都不一样。可以在怀孕晚期的时候监听胎心胎动，在饮食上面加强营养，促使胎儿能够正常发育防止发育畸形。