怀孕三个月流产会疼。所有流产或者是引产都会痛的，对身体都会造成伤害的。怀孕三个月胎儿已成型，已经不能做流产，需要住院引产，而且还需要开引产的证明，风险增大。一般来说怀孕三十五天到五十五天是做无痛人流最好的时间，这个时候的子宫不是很大，而且胎儿和胎盘都还没有成型。