巧克力囊肿不一定必须手术，如果囊肿较小，可以采取保守治疗的方法医治。如果囊肿较大影响了正常的孕育功能，可以采取手术切除的方法医治，但是在做手术之前需要与医生沟通好，如果有生育要求，最好不要切除子宫，而且在手术之后还需要定期复查，因为巧克力囊肿有很高的复发率。